Buenas tardes, mi nombre es
Francisco Díez fuertes
y trabajó en el Centro Nacional de
Microbiología del Instituto de Salud
Carlos tercero y en primer lugar
me gustaría agradecer
a los organizadores del curso
habernos invitado a hablar
sobre las principales variantes que
han dominado la epidemia de sars
CoV dos en España.
En primer lugar, me gustaría
escribir un poco la historia
de cómo, cómo se consiguió el primer
genoma completo del nuevo virus.
Esta historia comenzó el 20
de diciembre de 2019
en nombre de 41 años.
Un trabajador de mercado de marisco
de la ciudad, dibujante, que comenzó
a sentir síntomas y a los seis días
fue ingresado en el Hospital Central
de veintiseis de diciembre de 2019,
tan solo 10 días después,
los investigadores consiguieron
obtener el genoma completo
de este nuevo virus y enviarlo
para su publicación
el cinco de enero de 2020
como es nuestro aquí abajo.
El primer primer caso,
datado hasta la fecha de infección
por sars CoV,
dos data del uno de diciembre
de 2019.
En la mayoría de los casos
están relacionados
con el mercado de mariscos
que comentábamos antes.
Este genoma está compuesto por
unos 30.000 nucleótidos,
que contiene dos tercios de su genoma
-codifican, para dos grandes
que, a su vez,
codifican para las proteínas
que se acaban convirtiendo
en hasta 16 proteínas estructurales,
incluyendo la polimerasa,
dependiente de rne también codifica
cuatro proteínas estructurales
la montura la membrana, así como
varias proteínas accesorios
aquí abajo como un esquema de lo
que sería él las del virus.
Las diferentes partes que
componen esta urbe
rf prohibiéndole segundo,
con el dominio
de un receptor receptor
humano hace 2.
El dominio a esa edad.
Si el dominio.
El nuevo coronavirus es el séptimo
coronavirus con capacidad
de infectar a humanos y se ha
clasificado dentro del género
coronavirus y del género.
Cominos.
La nomenclatura de las diferentes
claros del sars
CoV dos ha sido complicada
desde el inicio
porque han aparecido diferentes
sistemas de nomenclatura
aquí pongo algunos de ellos.
Actualmente se utilizan sobre
todo este sistema;
el sistema, que se conoce como tango
clasificadas las diferentes grupos
de variantes en función de las
letras, las letras A,
y b
serían las secuencias más
ancestrales y las más modernas
en estos éstos van surgiendo
sus claras,
que van definiendo las
diferentes variantes
que se van describiendo.
Sin embargo,
hay otro sistema de clasificación
como el que utilizan en el año,
en el que se descubrieron cada uno
de estos claros, que están las 2019,
los claros, que fueron
apareciendo en 2020;
hay un tercer sistema,
el sistema del mi6,
que clasifica a los clavos en
función de mutaciones concretas
a lo largo del genoma del virus
y mucho más recientemente.
La Organización Mundial de la Salud
ha publicado un nuevo sistema
para nombrarlas, las diferentes
variantes
que van surgiendo utilizando letras
del alfabeto griego.
Este modo ha descrito hasta cuatro
variantes de preocupación,
alfabeto celta y creo que son 7,
siete variantes de interés, que son.
La diferencia principal entre los
claros descritas en 2019
en el 2020 es esta mutación,
una mutación de 614.
Estaría por ahí lo que lo que hace
es provocar un cambio estructural
que provoca una apertura de la
proteína hace más favorable
la, el reconocimiento y la
fusión receptor humano.
Bueno, me gustaría hablar sobre
las principales variantes
que han dominado la epidemia
en España,
en tres grandes fases, el
inicio de la epidemia.
Nosotros podemos publicar un
trabajo sobre este asunto
y más recientemente, una segunda
fase en el verano de 2020.
Para acabar con las famosas
variantes que se están expandiendo
por todo el mundo para estudiar cómo
llegó al coronavirus a España,
lo primero que hicimos
fue identificarlos;
los primeros países de Europa en
los que los que se detectaron
casos de sars CoV 2, que son
las que muestra aquí
en su publicación.
Es lo que hicimos nosotros,
simplemente fue recogen todas
las genomas secuenciado
hasta la fecha todos estos países,
junto con las secuencias de China,
para inferir la la probabilidad de
que estas variantes surgieran
o o se importaban directamente desde
Buján o preferentemente,
entre los diferentes países europeos.
Lo que pudimos concluir
en este estudio
es que el inicio de la pandemia será
en torno al 24 de noviembre de 2019
en origen en la ciudad
china de Bojan.
Y qué es lo más probable es que
se produjeran introducciones
en todos estos países europeos
directamente desde esta ciudad.
En este sentido cabe destacar
que por aquella época
había todos estos vuelos semanales
entre la ciudad
y las principales capitales europeas.
Como muestra, como muestra aquí.
A continuación nos planteamos
estudiar
los todos los genomas completos
enjuiciados hasta el momento,
que eran unos 12.500 genomas,
incluyendo un total de 219
secuenciado en España, y
61 de ellos secuencias
en el Instituto de Salud Carlos
tercero en la unidad
de virus respiratorios, del Centro
Nacional de Microbiología,
con la ayuda de las unidades
de Genómica
e Informática de Instituto.
Nos planteamos eso, estudiar el
inicio de la epidemia en España
recogiendo muestras de diferentes
hospitales
de toda España.
Una vez secuenciado se realizó
el análisis filogenético
y aquí os nos como pudimos
detectar representantes
de todos los clavos descritos hasta
ese momento en España,
identificando hasta 62 importaciones
diferentes.
Describimos cuatro pequeños castas,
que son las que aparecen en Rosa.
19 se esperaba,
así vente a ese plan luego
hablaremos un poco sobre ellos.
Aquellos muestran la izquierda
una evolución de las formas
genéticas en España,
viendo cómo el inicio, las nuevas,
las variantes de las claras 19,
parecían dominar la epidemia,
pero fueron paulatinamente
sustituidas por los lados.
Agradezco las primeras positivas.
La diferencia entre estos
claros, los 20
es principalmente, la
mutación de 614.
Como decía, describen los cuatro
grandes claros 19 se p1,
que adaptamos su origen en España en
torno al 21 de enero de 2020,
a ese p1,
cuyo origen también se dato
en torno al 29 de enero.
En España, el 19 de tiene su origen
el seis de febrero del 2020.
También en España, en ese período en
torno al 17 de febrero de 2020,
también en nuestro país, porque
es importante recordar,
es la cronología de cómo se
sucedieron la epidemia
en España.
El primer caso declarado
hasta ese momento
era del 31 de enero de
2020; un caso en La.
El segundo caso declarado fue el
nueve de febrero del 2020,
un caso en Palma de Mallorca
y hasta el 28 de febrero,
pues ya se detectaron
casos positivos,
y esto fue un aumento exponencial,
cinco de marzo, 251 casos,
y el día que comenzó el
confinamiento, pues ya había,
por lo menos más de 4.000 casos
positivos en España.
Lo que aportamos nosotros con
este estudio es decir,
que probablemente ya había
transmisión comunitaria de 2,
dos de estas variantes antes del
primer caso declarado en España
y otros dos a mediados
de febrero de 2020.
También pudimos describir cómo
se produjo este inicio
de la mínima en España, que estuvo.
Marcado principalmente por múltiples
introducciones,
como veíamos antes.
Un efecto fundador,
donde las variantes que llegaban
eran las que se establecían en ese momento
y a un período de coexistencia de
las variantes de 614 las 614,
que son las que acabaron
dominando la epidemia.
En España.
Este estudio tuvo bastante
repercusión
porque eso suponía.
Habíamos detectado, podíamos inferir
transmisión comunitaria en España
antes de las primeras
casas declarados.
Basta hasta ese momento.
También pudimos realizar
un ensayo in vitro,
en el que construimos unas Bodas
de sangre inocente,
y la intimidad, que expresaba la
proteína de la películas del virus
en superficie,
generando las variantes la variante
ancestral de 614, 614,
demostrando mayor efectividad en el
caso de la segunda votación,
614 en diferentes líneas celulares.
Aquí os pongo un poco la evolución
de esta mutación en España
desde el inicio de la pandemia
hasta la actualidad
como las formas g 614 han desplazado
completamente
a las 614.
Además, esto coincide con
trabajos ya publicados,
donde asocian esta mutación,
pues a una mayor efectividad
si una mayor replicación
en el tracto respiratorio superior
en ensayos in vivo.
En una segunda etapa, durante
el verano de 2020,
lo que vemos,
lo que ocurrió es la muestra
en esta área positiva.
Esto es lo que hemos
visto hasta ahora,
pues mi inicio marcado
por las formas,
19 a 19 en Europa y su institución
paulatina,
las formas frente, pero ya a
inicios del verano de 2020
comenzaron a aparecer nuevos
nuevas variantes.
Una de ellas es ésta que
se denomina 20 a 1.
Aquí se sospecha que se
originó en España
y se exportó al resto de Europa
un trabajo reciente
publicado en 2021.
No ha podido asociar esta variante
a ninguna ventaja patogenicidad
inicial,
sino que atribuye el éxito de la
expansión de esta variante.
Primera, una alta incidencia
de la variante en España.
Ha iniciado el inicio del verano.
Prudentes a una reapertura
del turismo,
haya un rastreo ineficaz.
Lo que hizo
fue que se expandiera por toda
Europa a medida que se iban abriendo
fronteras entre las diferentes
países europeos.
Y más recientemente, lo que ocurrirá
si la aparición en escena
de estas valientes las variantes que
ocupantes de interés actualmente
la oms ha descrito cuatro variantes
preocupantes, alfabeto gama alta
inicialmente descritas en Reino
Unido en Sudáfrica,
Brasil y en la India.
Estas variantes se denominan
preocupantes
porque han demostrado que tienen
ciertas ventajas ideológicas,
como las que tomaban aquí abajo;
aumento en su visibilidad,
incrementan la virulencia o descenso
de la efectividad
de las medidas de salud pública
y sociales frente a ellas,
pero también han descrito
otras siete ocupantes,
sino eta, eta Capa y Landa, que
tienen mutaciones concretas,
que podrían tener implicaciones
fenotípica
y que ahora mismo son variantes
de interés.
Hay una regla que va positiva;
no son preocupantes,
son variantes de interés;
más preocupantes
son las cuatro anteriores pero que
están bajo bajo vigilancia
y que podrían en cualquier momento
pasará a convertirse en variantes
preocupantes
es lo que tienen especial
estas motas.
Estas variantes son diferentes;
mutaciones principalmente importante
son las que se encuentran
en las colas y más concretamente
en esta zona,
en el dominio del receptor,
hace dos como veis,
todas ellas tienen mutaciones en
esta región y diferentes versiones
de mutaciones sin embargo parece que
los mecanismos que ha encontrado
el virus para, para buscar estas
ventajas biológicas
son limitados ya que como podéis
ver aquí hay varias mutaciones
que comparten varias entre las
diferentes variantes,
pero en primer lugar
vamos clave; 614; está presente
en todas ellas
a votación.
En las votaciones, en
la posición 4, 8,
cuatro también parecen encontrarse
en varias;
de ellas;
otro otra vía que ha encontrado la
posición 452 o la 501 con 681;
por ejemplo.
Muestro finalmente como según datos
de las bases de datos,
las diferentes variantes que se han
ido a secuenciar en nuestro país.
En España, valientes, preocupantes
y valientes de interés
vemos aquí en verde como la
variante que se originó
en el verano del 2020, la b1 177.
Pasó de dominar la epidemia durante
el verano de 2020 finales
del 2020 ser completamente
sustituida esta variante azul.
Esta variante azules,
la variante alfa,
inicialmente descrita en Reino Unido,
que igualmente llegó a dominar
la epidemia en España
durante los primeros meses del 2021.
Pero vemos cómo está comenzando a
decaer y principalmente parece
que está siendo sustituida
por otra variante.
La variante delta, que actualmente
supone el 40 con siete por 100
de los genomas esenciales en España.
Y el resto de variantes,
aunque hay representantes de
prácticamente todas ellas,
no parece que esté aumentando
su incidencia en España,
por lo menos en cuanto a
genoma secuenciado.
Una característica importante para
los sistemas de vigilancia
de estas variantes es la capacidad
de secuenciación
en diferentes países.
Actualmente España se sitúa
en el puesto 12 mundial
con 25.962 genomas secuenciado hasta
el 30 de junio de este año.
Esta, por detrás de países
como Estados Unidos,
secuencia de cuantos han secuenciado
440.000 genomas
o Reino Unido que ha secuenciado
320.000 genomas durante el año,
en el caso de Reino Unido estos
genomas suponen en torno
al 15 por 100 de todos los casos
diagnosticados en ese país
y lo que es más importante
es que son capaces
de dar esta información
en tan solo 12 días.
El retraso es mínimo.
Entre entre el momento en el
que se coge una muestra
y se publican los datos, en España
estamos una orden de magnitud.
Por debajo de este este nivel
se secuencia el uno
con cuatro por 100 de los
casos diagnosticados.
La una de las pegas es que quizás
hay un mayor retraso
en la publicación de los datos,
que va hasta los 28 días en
lo que va de año 2021.
Esto hace que nos fijemos
principalmente
en los datos que publica
el Reino Unido
sobre vigilancia epidemiológica, así
como efectividad de las vacunas,
y en este gráfico podremos ver
cómo la variante la variante
inicialmente detectada en Reino
Unido está siendo completamente sustituida
a medida que pasan las semanas por
la variante del inicialmente
detectada en la India.
Como también unos datos publicados
recientemente
por el Gobierno británico, hablan
sobre la efectividad real
de las vacunas en su población,
que está principalmente vacunada
con y con la técnica,
y veremos cómo la efectividad
de una dosis,
ya sea de hasta escénica
o de fallecer, es baja, ya era
baja con la variante Alfa
-pero es incluso más baja.
Ahora mismo,
con la variante lo mismo ocurre
con las dos dosis.
Parece ser que la eficacia para
prevenir la infección
de dos vacunas dos dosis de
la vacuna de fallecer,
tiene una efectiva mayor
que las dos dosis conseguidas con
la vacunación de génica,
a continuación expongo mismo gráfico
hablando sobre la efectividad
en el desarrollo de síntomas
y una vez infectado.
Vemos como en este caso una pauta
completa frente a la variante alfa,
era del 92 por 100 en
caso de fallecer
81 por 100 en el caso de la Zenica
y bajar relativamente
con la nueva variante, la
variante al 83 por 100
para las dosis de falsedad al
61 por 100 dosis de cínica.
Sin embargo,
es importante recordar que también
en este mismo informe Reino Unido,
al Gobierno británico habla de la
efectividad de estas vacunas
a la hora de evitar la
hospitalización
de personas infectadas,
y en este caso vemos cómo la
efectividad de las sobredosis,
ya sea en estos países, la
efectividad combinada
de ambas vacunas alcanzó
el 93 por 100.
En el caso de la variante
alfa y del 96 por 100
en el caso de la venta.
Finalmente, aquí os pongo
una comparación
de cómo se han ido produciendo las
diferentes oleadas de infecciones
tanto en Reino Unido como en España.
Vemos que es una gráfica muy similar.
En el caso del Reino Unido están
viendo ahora mismo una repunte
de casos probablemente atribuido
a la variante delta,
y en España la pregunta de si
sí o a medida que estaba
bien te vaya sustituyendo
al resto de variantes
va a producir también un incremento
del número de casos.
Previsiones tienen, pues, en
base a estos resultados
que hemos ido mostrando que
esta variante del Tau
se pueda ir asociada a una
mayor visibilidad
e incluso a un descenso en la
eficacia de las vacunas,
incluso se ha podido asociar también
a a una mayor probabilidad
de hospitalización.
En aquellas que se han infectado
con la variante.
Todo esto hace que se haya publicado
un informe con previsiones
para el mes de agosto en el que habla
de que en la primera semana de
agosto probablemente el 70 por 100
de todas las nuevas infecciones
en territorio europeo
se deban a esta variante,
a la variante de eta
y que probablemente alcance el
90 por 100 a finales de mes,
y finalmente habla de las
consecuencias que podría tener
una relajación de medidas
no farmacéuticas
durante este mes de junio.
Son no son otras que un poco.
Lo que hemos descrito ya es el
aumento de la incidencia
en todos los grupos de edad que
lleva asociado un incremento
de las hospitalizaciones y muertes
y se alcancen niveles similares
a los observados en otoño.
Y nada más.
Me gustaría agradecer a mi
principalmente a a los pacientes
que han participado en los estudios
que hemos mostrado
en todos estos hospitales
y a mis compañeros del Centro
Nacional de Microbiología,
y especialmente a los del
laboratorio de la Unidad de Patología
del trabajo.
Muchas gracias y ánimo.